Un estudio realizado por la Comisión Administradora del Río Uruguay (CARU) informó  que el río compartido entre Argentina y Uruguay presenta "valores superiores a los límites establecidos de concentración" de trece parámetros, entre los que se encuentran numerosos metales, aceites, grasas, bacterias de excrementos y plaguicidas.  El río marca parte del límite natural entre ambos países.

Las muestras fueron tomadas por el Comité Científico de la CARU entre junio y noviembre de 2018 en nueve sectores del río, desde Monte Caseros (provincia de Corrientes) hasta La Concordia (en Uruguay), sobre ambas márgenes y al centro del canal.

La CARU indicó que un total de trece parámetros de calidad de agua presentaron valores de concentración superiores a los límites establecidos por dicho organismo. Esto son restos de sustancias activas a azul de Metileno, plomo, y manganeso que se presentaron en exceso en menos del 3 por ciento de las 168 muestras tomadas. En tanto el hierro, los aceites y grasas y las sustancias fenólicas totales "exceden sistemáticamente los niveles" permitidos.